OpenBabel

У этого термина существуют и другие значения, см. Babel.
OpenBabel
Логотип программы OpenBabel
Тип Хемоинформатика
Написана на C++
Операционная система Кроссплатформенное программное обеспечение
Последняя версия 3.1.1 (8 мая 2020)
Репозиторий github.com/openbabel/ope…
Читаемые форматы файлов:
CML[1][2], International Chemical Identifier[3][2], MDL Molfile[вд][4][2], Protein Data Bank[d][5], FASTA[6], Alchemy Format[вд][7], Gaussian Cube File[вд][8], CDX Format[вд][9], CIF[10], XYZ file format[вд][11], Free Form Fractional format[вд][12] и MCDL format[вд]
Создаваемые форматы файлов:
SMILES[13][2], CML[1][2], International Chemical Identifier[3][2], InChIKey[вд][14][2], MDL Molfile[вд][4][2], Multilevel Neighborhoods of Atoms format[вд][15], Free Form Fractional format[вд][12], MCDL format[вд][16] и CAChe MolStruct[вд][17]
Лицензия GNU General Public License
Сайт openbabel.sourceforge.net/…

OpenBabel — свободная химическая экспертная система, в основном используемая для преобразования форматов файлов. Эта программа доступна для UNIX и Windows и распространяется на условиях GNU GPL.

OpenBabel, так же как и JOELib, основан на библиотеке OELib, которая, в свою очередь, использовала идеи из программы Babel.

Основные возможности

  • Химическая экспертная система
  • Преобразование форматов
  • Поиск фрагментов (с помощью SMILES)

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 Chemical Markup Language (cml, mrv)
  2. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Supported File Formats and Options
  3. ↑ 1 2 InChI format (inchi)
  4. ↑ 1 2 MDL MOL format (mol, mdl, sdf, sd)
  5. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Protein_Data_Bank_format.html
  6. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/FASTA_format.html
  7. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Alchemy_format.html
  8. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Gaussian_cube_format.html
  9. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/ChemDraw_binary_format.html
  10. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Crystallographic_Information_File.html
  11. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/XYZ_cartesian_coordinates_format.html
  12. ↑ 1 2 http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Free_Form_Fractional_format.html
  13. ↑ SMILES format (smi, smiles)
  14. ↑ InChIKey (inchikey)
  15. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/Multilevel_Neighborhoods_of_Atoms_(MNA).html
  16. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/MCDL_format.html
  17. ↑ http://openbabel.org/docs/2.3.0/FileFormats/CAChe_MolStruct_format.html

Ссылки

  • Домашняя страница OpenBabel Архивная копия от 25 февраля 2008 на Wayback Machine